物流公司信息化失败带来的后果往往比预想的严重一点，因为在没有实施信息化之前，想的只是软件的成本的损失而已，而实际面临信息化失败时，所经受的损失大得多，主要表现在以下几点：
1、    直接的软件成本损失：到目前为止，业界还没有如果信息化失败则软件公司赔付原款的先列，也就是说，如果信息化失败，直接的软件成本，还是由企业买单。
2、    失败造成错误的直接损失：直接损失的当然是比较少发生，因为很多的企业信息化开始实施前是电脑和人工同时进行的。但是由于测试的数量及范围的限制，在流程还没有完程就使用信息化操作，难免会因为失误造成一些直接的损失。
3、    隐性信息化失败损失：当信息化失败的发生为隐性时，即由软件计算为不精确而操作员却过份依赖软件时，所造成的错误将会无法弥补，如果该错误在数月后才发现，其所造成的糊涂帐事后几乎无法再能用人力来补救。
4、    直接管理成本的损失：参与信息化的人员越多，所需要的管理、学习、协调等工作就越多，这些人就必须得花很多的工作时间参与进去，一些企业高层，为了实施信息化，动用了制度等管理工具，一旦信息化失败这些努力将成为零。
5、    直接时间的损失：企业信息化需要花费全体员工的大量时间，这些时间的损失将间接地影响企业其他项目的运作。
6、    企业品牌的损失：当失败造成的错误最终由客户买单时，客户就会对该信息化企业失去信任，一次的信任发生到多个客户身上，这对企业来说就是一个致命的企业品牌危机。
7、    评估成本的损失：评估软件产品需要花费人力物力，如果一个产品还要试用，那将花费的时间更长，信息化前要评估，信息化失败后还要重新评估。
8、    员工信心的损失：物流企业信息化是一个长期的工程，对数据的录入以及流程的改造要花费很长的时间及精力，如果最终让员工知道所有的努力化为乌有，员工将会对下次信息化工程或类似工程失去信心。
9、    员工信任的损失：因为信息化失败，员工将对主管失去信任，而如果是信息化某个细节出了问题，也可能主管也会对员工造成信任危机。